I debatten tog hon upp begreppet "utomrättsliga avrättningar", i samband palestiniers knivattacker mot israeler och Israels rätt att försvara sig.
Israels premiärminister Benjamin Netanyahu har fördömt uttalandet.
I söndagens Agenda i SVT ansåg sig Margot Wallström avsiktligt missuppfattad.
"Det är väldigt tydligt hur det här har spunnits i sociala medier", sa hon i SVT Agenda.
Liberalernas partiledare Jan Björklund säger i sin tur att han i en interpellation kommer att kräva en förklaring från Margot Wallström och att hon presenterar belägg för "mycket grova anklagelser" mot ett annat land, något som TT har berättat om.
Under söndag kväll skickade statsminister Stefan Löfven (s) och Margot Wallström ut en kommentar:
"Situationen i Mellanöstern är besvärlig nog, utan att behöva tyngas av missförstånd om någons avsikter. Och det är olyckligt när kraftiga reaktioner sker på felaktiga grunder."
Och vidare:
"Den senaste missuppfattningen gäller fredagens interpellationsdebatt i riksdagen. Utrikesministern sa inte, vilket påståtts, att utomrättsliga avrättningar förekommer i Israel, utan förde ett principiellt folkrättsligt resonemang om rätten att försvara sig och om vikten av proportionalitets- och distinktionsprincipen."
Utvalda kategorier

Rolf van den Brink
DO JOBB
Almega söker näringspolitisk expert
Tror du på fri företagsamhet och att privata företag är viktiga i välfärden? Vill du vara med och förbättra förutsättningarna för Sveriges tjänsteföretag? Då ska...
Group IR & Communication Manager till Attendo
Attendo är ett av Nordens ledande omsorgsföretag och är noterat på Nasdaq Stockholm. I takt med att koncernen växer och utvecklas stärks nu den centrala...